История кафедры анатомии человека начинается с организации в 1918 году Таврического университета, в структуре которого предусматривался медицинский факультет. Первым ректором университета был известный анатом, ученик П. Ф. Лесгафта – профессор Роман Иванович Гельвиг, который и основал кафедру анатомии человека.

В 1930 году открылся Крымский медицинский институт. Кафедру анатомии человека возглавил ученик академика В. П. Воробьева – профессор Виктор Владимирович Бобин. При нём создан анатомический музей, рентгеновский кабинет, научные лаборатории и секционные для работы на трупах, а также учебные и лекционные аудитории. Под руководством проф. В.В.Бобина начали свой путь в науку В. И. Зяблов, Д. А. Сигалевич, В. В. Ткач, ставшие известными учеными. Проф. В.В. Бобиным было опубликовано свыше 100 научных работ, подготовлено 10 кандидатов и 3 доктора наук.

С 1967 года по 1993 год кафедру возглавлял ученик В. В. Бобина - профессор Владимир Ильич Зяблов. За этот период кафедра материально укрепилась: были оборудованы научные лаборатории, операционная, виварий и пр. Проф. В.И.Зяблов умело сочетал административную (ректор), общественную работу с научно-исследовательской. Основное направление исследований сотрудников кафедры было посвящено проблеме морфогенеза и регенерации центральной и периферической нервной системы. Исследования комплексировались с НИИ и вузами Москвы, Киева, Харькова. Второе научное направление, возглавляемое проф. В. В. Ткачом, исследует влияние спинно-мозговой жидкости на морфогенез органов и тканей.

В это же время на кафедре работал Г.Н.Петров, который еще в конце 50-х годов впервые в мире оплодотворил и проследил в пробирке все стадии дробления яйцеклетки человека – до 26 часов жизни эмбриона, тем самым фактически став основоположником нового направления в биологии - «экстракорпорального оплодотворения».В целом сотрудниками кафедры было опубликовано более 600 научных работ, в том числе монографии, статьи, изобретения и др. Защищено 6 докторских и 43 кандидатских диссертаций.

В 1993-94 годах кафедрой руководил нынешний ректор Крымского государственного медицинского университета им. С. И. Георгиевского, доктор медицинских наук, профессор А. А. Бабанин. В последующие годы кафедру возглавляли профессора Н.И. Шкодивский, И. В. Заднипряный, доценты С. Я. Коваль и В. В. Лысенко.

С 2001 кафедрой заведует доктор медицинских наук, профессор В. С. Пикалюк, ученик известного анатома профессора В. Г. Ковешникова.

На кафедре создан музей анатомии человека и истории морфологии. В настоящее время экспозиционная площадь составляет 605,7 кв. м., на которых располагается 1405 экспонатов. За последние три года фонд экспонатов пополнили 185 натуральных препаратов, 250 рисунков, макетов, моделей, барельефов. Кроме того, в музее содержится галерея портретов морфологов, рисунков и репродукций по анатомии, экспозиции, связанные с деятельностью Н. И. Пирогова и С. Н. Боткина в период Крымской войны (1854-1855 гг.), так как сам музей и кафедра занимает здание бывшего военного госпиталя (памятник архитектуры 18 века).